Fantom, на самом деле ничего сложного нет. По крайней мере с той системой, которой я сталкивался - все было просто: запускаешь утилиту, вводишь пароль и система пускает тебя в программу. Поэтапно совершаешь определенные действия, настраиваешь необходимые параметры и в конце программируешь смарт-карты через настольный считыватель (подносишь одну за одной через интервал 3-5 сек.). Я имею ввиду только программирование карт для входа в офис - с банковскими не сталкивался(((((
А что за система установлена в комплексе?